转录组学概述

转录组定义

广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合；狭义上指所有 mRNA 的集合。

转录组学定义

转录组学指一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。

转录组学技术流程

cDNA合成过程
cDNA指互补DNA，由RNA经一种称为逆转录酶的DNA聚合酶催化产生的。具体过程包括：首先，以mRNA为模板，在逆转录酶的作用下合成单链cDNA；然后，以单链cDNA为模板，由依赖DNA的DNA多聚酶合成双链cDNA。

转录组学样品合格性判定

OD260是核酸吸收峰，OD280是蛋白吸收峰。OD260/280≥1.8，在2.0左右。
OD230是污染物，某些有机试剂和多糖的吸收峰，OD260/230≥1.8，说明核酸较纯，若这个值很低，说明有有机试剂或多糖污染。
下表中Level A满足芯片实验要求。

qRT-PCR

RT-PCR
RT: Reverse Transcription ，
逆转录源自于病毒，反转录酶，依赖 RNA的DNA 聚合酶

RT-PCR（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction）是将RNA的反转录（RT）和cDNA的聚合酶链式扩增（PCR）相结合的技术。首先经反转录酶的作用，从RNA合成cDNA（逆转录），再以cDNA为模板，在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。

提取总RNA（RNA提取试剂盒）- 纯化总RNA（纯化试剂盒）- 反转录cDNA（逆转录试剂盒）- RT-PCR（荧光定量PCR试剂盒）